Серверный код находится в директории dlls.
Здесь содержится код для компиляции модуля server.dll.
Серверные классы обычно имеют имена подобные CИмя (CBaseEntity, CBasePlayer).
Код клиента находится в директории cl_dll.
Соответствующий модуль для клиента - client.dll.
Классы клиента обычно имеют имена подобные C_Имя (C_BaseEntity, C_BasePlayer).
Здесь содержится код управлющий рендерингом моделей, озвучкой, обработка GUI-интерфейса, вывод текстовых сообщений, обработка ввода клавиатуры и мыши и т.д.
Общий код лежит в директориях public и game_shared.