В доме Фримена раздается телефонный звонок. Ему звонит Рей Розенберг, Сотрудник Пентагона и куратор
всех сверхсекретных научноисследовательских комплексов США. Он предлагает Фримену работу в одном из таких комплексов.
Фримен принимает предложение и отправляется в Сан-Франциско. В аэропорту Сан-Франциско его встречает человек в строгом
костюме с дипломатом в руке.
Они садятся в машину и уезжают. Артур Бэйли отвозит Фримена в свой офис для подписания контракта.
Пока Бэйли готовит необходимые бумаги, очаровательная секретарша приносит Фримену поднос с кофе и фруктами.
Он выпивает кофе и теряет сознание. Фримена доставляют в Черную Мезу в бессознательном состоянии.
Врачам с трудом удается вернуть его в наш мир, поскольку доза снотворного была очень сильной.
Фримен приходит в себя в медблоке. Пожилой врач говорит ему о необходимости прохождения регистрации.
Фримен выходит из медблока и натыкается на странную процессию. Двое охранников в защитных костюмах синего цвета
везут на тележке сильно обожженный труп в таком же костюме, только оранжевого цвета. Фримен проходит мимо них и садится в поезд.
Прибыв в сектор D Фримен проходит регистрацию и получает специальную карту, которая позволяет ему перемешаться по некоторым частям комплекса.
На поезде Фримен добирается до нижних уровней общежития. Попутно он знакомится с Илаем Венсом.
На следующий день Фримен отправляется на тренировку в сектор A. Пройдя тренировку Фримен снова
возвращается в общежитие. Через два дня Фримен выходит на работу. С этого момента начинается оригинальный сюжет первой части HALF-LIFE.
После уничтожения Нихиланта на одном из выступов, которые торчат из
стен его комнаты, зараждается телепорт из которого выходит Артур Бэйли. Фримен прыгает в этот телепорт и оказывается где-то на территории Ксена.
Здесь Бэйли рассказывает Фримену о том, что администратор Мезы долгое время работал на пришельцев и передавал им всю
информацию о человечестве, и тот самый кристалл был доставлен на землю по его приказу. Бэйли настраивает свой портативный
телепорт на координаты земли, но у него ничего не выходит. Наши герои перемещаются по Ксену несколько раз. Наконец Артуру удается
настроить телепорт, но батареи устройства оказываются почти полностью разряженными.
Фримен отправляется на землю, а Бэйли остается в Ксене. Фримен оказывается в той же лаборатории,
откуда его отправили в Ксен. Через некоторое время на шум приходит охранник. Он узнает Фримена и выводит его из лаборатории.
Охранник приводит Фримена в одно из уцелевщих помещений сектора F, Где ученые расскажут ему историю создания Черной мезы.
Ближе к концу истории в лабораторию вбежит другой ученый и скажет о зарождении огромного телепорта между орбитами
Земли и Луны, из которого выходит большой звездолет. Один из Вортигонтов, которые стали нашими союзниками, расскажет об Альянсе.
Понимая, что человечеству пришел каюк, Фримен спешит на поверхность. Тем временем Альянс начинает вторжение.
На поверхности машина Фримена подвергается нападению.
Ее захватывает транспортник Альянса. Транспорт улетает неизвестном направлении.